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自身免疫的产生是一个普遍现象，当免疫系统对自身正常的和因某种或某些内因外因，而改变了组织、器官、细胞、蛋白质或酶类发生了免疫应答，自身耐受的完整性遭破坏时，称自身免疫，因自身免疫招致组织器管损伤或功能障碍所致的疾病谓自身免疫性疾病。自身免疫的后果取决于自身耐受完整性受损的程度，有的很轻也可十分严重，自身免疫可以包括涉及抗体、补体、免疫复合物及细胞介导的免疫。正常情况下，自身免疫是一种保护性防御机制，维持完整的自身耐受性；在特殊情况下，自身免疫亢进，引起各种自身抗体的产生，组织损伤Ts或Th细胞数目或功能改变而导致自身免疫性疾病产生T细胞介导的自身免疫性疾病。
桥本氏甲状腺炎多见于中年妇女，因甲状腺被破坏而形成甲状腺机能减退或甲状腺肿，当滤泡破坏到一定程度时，甲状腺激素的产生下降，病人出现皮肤干燥，颜面浮肿，头发和指甲脆裂、怕冷等症。
胰岛素依赖型糖尿病（IDDM），很多器官特异性自身免疫性疾病是由自身反应性T细胞引起，IDDM患者的胰岛四周有淋巴细胞和巨噬细胞浸润，产生胰岛素的β细胞被破坏，胰岛素缺乏，葡萄糖代谢障碍，口渴多尿以致酮症酸中毒。
β细胞的破坏，目前认为包括细胞溶解性 T 淋巴细胞所介导的胰岛细胞的溶解，局部产生了细胞因子，以及由于产生了抗胰岛细胞的自身抗体，在该病的急性期有胰岛破坏和CD4+ 、CB8+T 细胞浸润，IDDM病人血中可测出抗胰岛细胞和抗胰岛素的自身抗体。在IDDM出现之前，往往有病毒感染，特别是柯萨奇B—4病毒的感染，触发自身免疫性应答。所以我们在治疗糖尿病时十分重视抗体，自身免疫的调节。
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